Со слов автора Albert C. Jude, между окрасом кошки и ее размерами часто имеют связь – было замечено, что ген коричневого цвета способствует увеличению размеров. К примеру, можно взять коричневых табби котов, которые при хороших условиях из них могут вырасти довольно большие питомцы. Многие животные имеют другие «цветные» гены, которые провоцируют увеличение размеров, но они пока не найдены у кошек. А вот присутствие гена «серебра» приводит к уменьшению размеров кошки. Даная зависимость присутствует у шиншилл, серебристых табби и возможно у сиамских кошек. Скорее всего, есть связь между структурой скелета и окрасом шерсти кошки – у коричневого табби крепкий костяк, а у шиншилл, сиамских и серебристых табби – более «легкий».
В результате исследований в 2003 году стало известно, что черный окрас шерсти может оказывать на влияние как на характер, так и на здоровье кошки, поскольку у гена черного может быть связь с остальными полезными мутациями. Из 37-ми видов кошек, 11-ть видов (также и домашняя кошка) имеют мутации, которые способствуют появление черных особей: Шотландская дикая кошка, гепард, сервал, каракал, Азиатская золотая кошка, ягуар, рысь, леопард. Самое распространенное объяснение закреплению мутации — лучшая маскировка.
Но на изменение окраса могут влиять и другие мутации. Мутации, которые способствуют появлению черного цвета шерсти принадлежат к виду генов, которые похожи на те, которые приводят к человеческим болезням, таким, как СПИД. Поэтому кошки могут обладать лучшей сопротивляемостью к болезням, нежели кошки других окрасов. Это известно по результатам исследований Stephen O’Brien и Eduardo Eizirik из Национального института рака США.
Помимо этого, темные окрасы пользуются преимуществом лишь в ночное время или в густых подлесках, а вот мраморные – на закате, рассвете и в пятнистой тени.
По исследованиям учеными молекулярной основы мутаций, дающие кошке эволюционные преимущества, стало известно два гена, которые имеют связь с меланизмом у кошек, а также изменения в гене «агути», который контролирует присутствии черноты в шерсти кошки. У абиссинских и подобных пород кошек все тело имеет шерсть агути.